近年来php网站在互联网上的比重越来越大，利用php程序漏上传php代码级的木马程更广泛地出现在虚拟主机甚至大型网站。常规杀毒软件、木马软件无法对与网站完全近似的代码进行扫描、识别、防护，黑客们更是不乐于此道。目前危害网络的主要是利用php程序对互联网其它机发起udp攻击，大量感染php木马机器在同时对目标服务器发起攻击，形成大流量UDP DDdos 分布式流量攻击。感染php服务器cpu及带宽同时全部跑满，对所在网络影响非常大。清理、发现php木马是各机房、网管非常重要的工作之一。
1、防止跳出web目录
首先修改httpd.conf，如果你只允许你的php脚本程序在web目录里操作，还可以修改httpd.conf文件限制php的操作路径。比如你的web目录是/usr/local/apache/htdocs，那么在httpd.conf里加上这么几行：
php_admin_value open_basedir /usr/local/apache
/htdocs
这样，如果脚本要读取/usr/local/apache/htdocs以外的文件将不会被允许，如果错误显示打开的话会提示这样的错误：
Warning: open_basedir restriction in effect. File is in wrong directory in
/usr/local/apache/htdocs/open.php on line 4
等等。
2、防止php木马执行webshell
打开safe_mode，
在，php.ini中设置
disable_functions= passthru，exec，shell_exec，system
二者选一即可，也可都选
3、防止php木马读写文件目录
在php.ini中的
防内网攻击标准配置 disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system,stream_socket_server,fsocket,fsockopen
后面加上php处理文件的函数
主要有
fopen，mkdir，rmdir，chmod，unlink，dir
fopen，fread，fclose，fwrite，file_exists
closedir，is_dir，readdir.opendir
fileperms.copy，unlink，delfile
即成为
disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system,fopen,mkdir,rmdir,chmod,unlink,dir,fopen,fread,fclose,fwrite,file_exists
,closedir,is_dir,readdir.opendir,fileperms.copy,unlink,delfile
PHP脚本DDOS攻击的原因及php脚本部分源码：
- $fp = fsockopen("udp://$ip", $rand, $errno, $errstr, 5);
- if($fp){
- fwrite($fp, $out);
- fclose($fp);
php脚本中的 fsockopen 函数，对外部地址，通过UDP发送大量的数据包，攻击对方。
解决方案：可通过 php.ini ，禁用 fsockopen 函数，及使用Windows 2003的 安全策略 屏蔽本机的UDP端口。
1、禁用 fsockopen 函数 。
查找到 disable_functions ，添加需禁用的函数名，如下：
- passthru,exec,system,chroot,scandir,chgrp,chown,shell_exec,proc_open,proc_get_status,ini_alter,ini_alter,ini_restore,dl,pfsockopen,openlog,syslog,
- readlink,symlink,popepassthru,stream_socket_server,fsocket,fsockopen
重启IIS后即可生效。
防UDP 等对外攻击，可以使用下面的代码。
disable_functions=passthru,exec,system,chroot,scandir,chgrp,chown,shell_exec,proc_open,proc_get_status,
ini_alter,ini_alter,ini_restore,dl,pfsockopen,openlog,syslog,readlink,symlink,popepassthru,stream_socket_server,fsocket,fsockopen
ok，大功告成，php木马拿我们没辙了，遗憾的是这样的话，利用文本数据库的那些东西就都不能用了。
如果是在windos平台下搭建的apache我们还需要注意一点，apache默认运行是system权限，这很恐怖，这让人感觉很不爽.那我们就给apache降降权限吧。
net user apache fuckmicrosoft /add
net localgroup users apache /del
ok.我们建立了一个不属于任何组的用户apche。
我们打开计算机管理器，选服务，点apache服务的属性，我们选择log on，选择this account，我们填入上面所建立的账户和密码，重启apache服务，ok，apache运行在低权限下了。
实际上我们还可以通过设置各个文件夹的权限，来让apache用户只能执行我们想让它能干的事情，给每一个目录建立一个单独能读写的用户。这也是当前很多虚拟主机提供商的流行配置方法哦，不过这种方法用于防止这里就显的有点大材小用了。